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Granted Patent B2
US 10,563,221 · App. 16/001,133 · Granted Feb 18, 2020

Insecticidal proteins and methods for their use

Inventors: Lu Liu (Palo Alto, CA); Jessica O'Rear (Redwood City, CA); Young-Jun Park (Pleasanton, CA); Barbara Rosen (Mountain View, CA); Ute Schellenberger (Palo Alto, CA); Eric Schepers (Port Deposit, MD); Jun-Zhi Wei (Hayward, CA); Weiping Xie (East Palo Alto, CA); Nasser Yalpani (Johnston, IA); Xiaohong Zhong (San Leandro, CA); Genhai Zhu (San Jose, CA)
Assignees: PIONEER HI-BRED INTERNATIONAL, INC.; E I DU PONT DE NEMOURS AND COMPANY
C12N15/8286A01N63/02C07K14/21C12R1/40Y02A40/162
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Quick Facts
Patent No.
US 10,563,221
App. No.
16/001,133
Granted
Feb 18, 2020
Kind
B2
Abstract

Compositions and methods for controlling pests are provided. The methods involve transforming organisms with a nucleic acid sequence encoding an insecticidal protein. In particular, the nucleic acid sequences are useful for preparing plants and microorganisms that possess insecticidal activity. Thus, transformed bacteria, plants, plant cells, plant tissues and seeds are provided. Compositions are insecticidal nucleic acids and proteins of bacterial species. The sequences find use in the construction of expression vectors for subsequent transformation into organisms of interest including plants, as probes for the isolation of other homologous (or partially homologous) genes. The pesticidal proteins find use in controlling, inhibiting growth or killing Lepidopteran, Coleopteran, Dipteran, fungal, Hemipteran and nematode pest populations and for producing compositions with insecticidal activity.

Claims (17)

1. A variant PIP-47 polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 80% identity to SEQ ID NO: 2, wherein the variant PIP-47 polypeptide has insecticidal activity.

2. The variant PIP-47 polypeptide of claim 1 , wherein the PIP-47 polypeptide is selected from: SEQ ID NO: 221, SEQ ID NO: 222, SEQ ID NO: 223, SEQ ID NO: 224, SEQ ID NO: 225, SEQ ID NO: 226, SEQ ID NO: 227, SEQ ID NO: 228, SEQ ID NO: 229, SEQ ID NO: 230, SEQ ID NO: 231, SEQ ID NO: 232, SEQ ID NO: 233, SEQ ID NO: 234, SEQ ID NO: 235, SEQ ID NO: 236, SEQ ID NO: 237, SEQ ID NO: 238, SEQ ID NO: 239, SEQ ID NO: 240, SEQ ID NO: 241, SEQ ID NO: 242, SEQ ID NO: 243, SEQ ID NO: 244, SEQ ID NO: 245, SEQ ID NO: 246, SEQ ID NO: 247, SEQ ID NO: 248, SEQ ID NO: 249, SEQ ID NO: 250, SEQ ID NO: 251, SEQ ID NO: 252, SEQ ID NO: 253, SEQ ID NO: 254, SEQ ID NO: 255, SEQ ID NO: 256, SEQ ID NO: 257, SEQ ID NO: 258, SEQ ID NO: 259, SEQ ID NO: 260, SEQ ID NO: 261, SEQ ID NO: 262, SEQ ID NO: 263, SEQ ID NO: 264, SEQ ID NO: 265, SEQ ID NO: 266, SEQ ID NO: 267, SEQ ID NO: 268, SEQ ID NO: 269, SEQ ID NO: 270, SEQ ID NO: 271, SEQ ID NO: 272, SEQ ID NO: 273, SEQ ID NO: 274, SEQ ID NO: 275, SEQ ID NO: 276, SEQ ID NO: 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3. A composition comprising the variant PIP-47 polypeptide of claim 2 .

4. A fusion protein comprising the variant PIP-47 polypeptide of claim 2 .

5. A method for controlling an insect pest population, comprising contacting the insect pest population with an insecticidally-effective amount of the variant PIP-47 polypeptide of claim 2 .

6. A method of inhibiting growth or killing an insect pest, comprising contacting the insect pest with a composition comprising an insecticidally-effective amount of the variant PIP-47 polypeptide of claim 2 .

7. A method for controlling an insect pest population resistant to a pesticidal protein, comprising contacting the insect pest population with an insecticidally-effective amount of the variant PIP-47 polypeptide of claim 2 .

8. A method of controlling Lepidoptera and/or Coleoptera insect infestation in a transgenic plant and providing insect resistance management, comprising expressing in the transgenic plant the variant PIP-47 polypeptide of claim 2 .

9. A DNA construct comprising a nucleic acid molecule encoding the variant PIP-47 polypeptide of claim 1 , operably linked to a heterologous regulatory element.

10. The DNA construct of claim 9 , wherein the encoded variant PIP-47 polypeptide comprises an amino acid sequence selected from: SEQ ID NO: 221, SEQ ID NO: 222, SEQ ID NO: 223, SEQ ID NO: 224, SEQ ID NO: 225, SEQ ID NO: 226, SEQ ID NO: 227, SEQ ID NO: 228, SEQ ID NO: 229, SEQ ID NO: 230, SEQ ID NO: 231, SEQ ID NO: 232, SEQ ID NO: 233, SEQ ID NO: 234, SEQ ID NO: 235, SEQ ID NO: 236, SEQ ID NO: 237, SEQ ID NO: 238, SEQ ID NO: 239, SEQ ID NO: 240, SEQ ID NO: 241, SEQ ID NO: 242, SEQ ID NO: 243, SEQ ID NO: 244, SEQ ID NO: 245, SEQ ID NO: 246, SEQ ID NO: 247, SEQ ID NO: 248, SEQ ID NO: 249, SEQ ID NO: 250, SEQ ID NO: 251, SEQ ID NO: 252, SEQ ID NO: 253, SEQ ID NO: 254, SEQ ID NO: 255, SEQ ID NO: 256, SEQ ID NO: 257, SEQ ID NO: 258, SEQ ID NO: 259, SEQ ID NO: 260, SEQ ID NO: 261, SEQ ID NO: 262, SEQ ID NO: 263, SEQ ID NO: 264, SEQ ID NO: 265, SEQ ID NO: 266, SEQ ID NO: 267, SEQ ID NO: 268, SEQ ID NO: 269, SEQ ID NO: 270, SEQ ID NO: 271, SEQ ID NO: 272, SEQ ID NO: 273, SEQ ID NO: 274, SEQ ID NO: 275, SEQ ID NO: 276, SEQ ID NO: 277, SEQ ID NO: 278, SEQ ID NO: 279, SEQ ID NO: 280, SEQ ID NO: 281, SEQ ID NO: 282, SEQ ID NO: 283, SEQ ID NO: 284, SEQ ID NO: 285, SEQ ID NO: 286, SEQ ID NO: 287, SEQ ID NO: 288, SEQ ID NO: 289, SEQ ID NO: 290, SEQ ID NO: 291, SEQ ID NO: 292, SEQ ID NO: 293, SEQ ID NO: 294, SEQ ID NO: 295, SEQ ID NO: 296, SEQ ID NO: 297, SEQ ID NO: 298, SEQ ID NO: 299, SEQ ID NO: 300, SEQ ID NO: 301, SEQ ID NO: 302, SEQ ID NO: 303, SEQ ID NO: 304, SEQ ID NO: 305, SEQ ID NO: 306, SEQ ID NO: 307, SEQ ID NO: 308, SEQ ID NO: 309, SEQ ID NO: 310, SEQ ID NO: 311, SEQ ID NO: 312, SEQ ID NO: 313, SEQ ID NO: 314, SEQ ID NO: 315, SEQ ID NO: 316, SEQ ID NO: 317, SEQ ID NO: 318, SEQ ID NO: 319, SEQ ID NO: 320, SEQ ID NO: 321, SEQ ID NO: 322, SEQ ID NO: 323, SEQ ID NO: 324, SEQ ID NO: 325, SEQ ID NO: 326, SEQ ID NO: 327, SEQ ID NO: 328, SEQ ID NO: 329, SEQ ID NO: 330, SEQ ID NO: 331, SEQ ID NO: 332, SEQ ID NO: 333, SEQ ID NO: 334, SEQ ID NO: 335, SEQ ID NO: 336, SEQ ID NO: 337, SEQ 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ID NO: 864, SEQ ID NO: 865, SEQ ID NO: 888, SEQ ID NO: 889, SEQ ID NO: 890, SEQ ID NO: 891, SEQ ID NO: 892, SEQ ID NO: 893, SEQ ID NO: 894, SEQ ID NO: 895, SEQ ID NO: 896, SEQ ID NO: 897, SEQ ID NO: 898, SEQ ID NO: 899, SEQ ID NO: 900, SEQ ID NO: 901, SEQ ID NO: 902, SEQ ID NO: 903, SEQ ID NO: 904, SEQ ID NO: 905, SEQ ID NO: 906, SEQ ID NO: 907, SEQ ID NO: 908, SEQ ID NO: 909, SEQ ID NO: 916, SEQ ID NO: 917, SEQ ID NO: 918, SEQ ID NO: 919, SEQ ID NO: 920 and SEQ ID NO: 921.

11. An isolated polynucleotide comprising a nucleic acid molecule encoding the variant PIP-47 polypeptide of claim 1 .

12. The isolated polynucleotide of claim 11 , wherein the variant PIP-47 polypeptide is selected from: SEQ ID NO: 221, SEQ ID NO: 222, SEQ ID NO: 223, SEQ ID NO: 224, SEQ ID NO: 225, SEQ ID NO: 226, SEQ ID NO: 227, SEQ ID NO: 228, SEQ ID NO: 229, SEQ ID NO: 230, SEQ ID NO: 231, SEQ ID NO: 232, SEQ ID NO: 233, SEQ ID NO: 234, SEQ ID NO: 235, SEQ ID NO: 236, SEQ ID NO: 237, SEQ ID NO: 238, SEQ ID NO: 239, SEQ ID NO: 240, SEQ ID NO: 241, SEQ ID NO: 242, SEQ ID NO: 243, SEQ ID NO: 244, SEQ ID NO: 245, SEQ ID NO: 246, SEQ ID NO: 247, SEQ ID NO: 248, SEQ ID NO: 249, SEQ ID NO: 250, SEQ ID NO: 251, SEQ ID NO: 252, SEQ ID NO: 253, SEQ ID NO: 254, SEQ ID NO: 255, SEQ ID NO: 256, SEQ ID NO: 257, SEQ ID NO: 258, SEQ ID NO: 259, SEQ ID NO: 260, SEQ ID NO: 261, SEQ ID NO: 262, SEQ ID NO: 263, SEQ ID NO: 264, SEQ ID NO: 265, SEQ ID NO: 266, SEQ ID NO: 267, SEQ ID NO: 268, SEQ ID NO: 269, SEQ ID NO: 270, SEQ ID NO: 271, SEQ ID NO: 272, SEQ ID NO: 273, SEQ ID NO: 274, SEQ ID NO: 275, SEQ ID NO: 276, SEQ 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13. An expression cassette comprising a heterologous regulatory element operably linked to the isolated polynucleotide of claim 12 .

14. A transgenic plant or progeny thereof comprising the isolated polynucleotide of claim 12 .

15. Seed, grain or processed product thereof of the transgenic plant of claim 14 , wherein the seed comprises the isolated polynucleotide.

16. A method of inhibiting growth or killing an insect pest, comprising contacting the insect pest with a transgenic plant comprising the expression cassette of claim 13 .

17. A method for controlling an insect pest population resistant to a pesticidal protein, comprising contacting the insect pest population with a transgenic plant comprising the expression cassette of claim 13 .

Assignments (2)
NUNC PRO TUNC ASSIGNMENT Recorded Nov 29, 2022
From: E.I. DU PONT DE NEMOURS AND COMPANY
To: CORTEVA AGRISCIENCE LLC
Reel/Frame 063141/0155 →
ASSIGNMENT OF ASSIGNOR'S INTEREST Recorded Jun 6, 2018
From: LIU, LU; O'REAR, JESSICA; PARK, YOUNG; ROSEN, BARBARA; SCHELLENBERGER, UTE; SCHEPERS, ERIC J.; WEI, JUN-ZHI; XIE, WEIPING; YALPANI, NASSER; ZHONG, XIAOHONG; ZHU, GENHAI
To: PIONEER HI-BRED INTERNATIONAL, INC.; E. I. DU PONT DE NEMOURS AND COMPANY
Reel/Frame 045999/0112 →
Continuity (3)
Continuation 14912356
Provisional Application 61866747 · Aug 16, 2013
Related Publication 20180273974A1 · Sep 27, 2018